Музей находится на берегу Дуная, недалеко от города Дони-Милановац. Здание музея спроектировано таким образом, чтобы обеспечить максимальный доступ посетителей к археологическим находкам без угрозы для ценных раскопок.Когда вы войдете в здание, то увидите остатки 36 объектов – жилых домов, некрополей, а также святилищ, наличие которых указывает на то, что здесь когда-то находился и духовный центр культуры мезолита. В центральной части музея можно увидеть даже руины просторной площади, на которой проводились древние ритуалы.
Голографические реконструкции домов живописно демонстрируют быт людей доисторической эпохи. Для того, чтобы как можно лучше понять старинные обычаи, в музее находятся и реконструкции захоронений, обнаруженных в Лепенском Вире.
Выставка более 100 предметов быта включает жертвенники, орудия, украшения и керамику. Вы также сможете увидеть копии монументальных каменных скульптур, рыбовидный облик которых указывает на большое  значение Дуная для жителей Лепенского Вира. Подлинники этих скульптур хранятся в Национальном музее Белграда.